San Pedro de Mérida ist eine Gemeinde in der Provinz Badajoz, Extremadura. Ihre Ursprünge reichen in die westgotische Zeit zurück, und nach der Rückeroberung des Gebiets wurde sie von dem Orden von Santiago kontrolliert.
Der Tradition nach ist die westgotische Basilika, die die Gemeinde begründet hat, der Ort, an dem König Don Rodrigo sich nach der Schlacht von Guadalete im Jahr 711 zurückzog.
Nach dem Sturz des Ancien Régime im 19. Jahrhundert wurde es zu einer konstitutionellen Gemeinde.